Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm26657Q9CVR1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26657Q9CVR1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26657Q9CVR1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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