Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Otud1Q9CUB6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Otud1Q9CUB6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Otud1Q9CUB6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Otud1Q9CUB6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otud1Q9CUB6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otud1Q9CUB6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otud1Q9CUB6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otud1Q9CUB6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otud1Q9CUB6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otud1Q9CUB6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otud1Q9CUB6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Otud1Q9CUB6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Otud1Q9CUB6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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