Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fcf1Q9CTH6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms