Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms