Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pard3bQ9CSB4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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