Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klhl28Q9CR40 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms