Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc43Q9CR29 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc43Q9CR29 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms