Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg12Q9CQY1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms