Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Atp5f1Q9CQQ7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Atp5f1Q9CQQ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Atp5f1Q9CQQ7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atp5f1Q9CQQ7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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