Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Nicn1Q9CQM0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Nicn1Q9CQM0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nicn1Q9CQM0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Nicn1Q9CQM0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Nicn1Q9CQM0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Nicn1Q9CQM0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nicn1Q9CQM0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Nicn1Q9CQM0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Nicn1Q9CQM0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Nicn1Q9CQM0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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