Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Mrpl35Q9CQL6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Mrpl35Q9CQL6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mrpl35Q9CQL6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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