Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb9Q9CQJ8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms