Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms