Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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Atp6v0e1Q9CQD8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Atp6v0e1Q9CQD8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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