Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rab5aQ9CQD1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms