Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp2Q9CQ73 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp2Q9CQ73 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms