Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ncbp2Q9CQ49 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms