Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms