Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
StambpQ9CQ26 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
StambpQ9CQ26 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms