Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg3Q9CPX6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg3Q9CPX6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms