Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsmce3Q9CPR8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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