Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf8Q99PV0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms