Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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