Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rassf3Q99P51 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rassf3Q99P51 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms