Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcgf6Q99NA9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf6Q99NA9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms