Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramel1Q99MW3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms