Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd1Q99MV1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms