Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mccc1Q99MR8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms