Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrrtQ99MR6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrrtQ99MR6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms