Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprtQ99M80 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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