Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Nus1Q99LJ8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms