Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cstf3Q99LI7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms