Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp16Q99LG0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms