Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmp1Q99KU0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms