Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GatbQ99JT1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms