Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnip2Q99JG7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnip2Q99JG7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms