Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms