Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctu1Q99J10 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctu1Q99J10 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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