Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rnf144aQ925F3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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