Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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