Protein–RNA interactions for Protein: Q922R1

UPF0183 protein C16orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q922R1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q922R1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q922R1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q922R1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q922R1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q922R1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q922R1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q922R1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q922R1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q922R1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms