Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms