Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Afg3l1Q920A7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms