Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smarca5Q91ZW3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms