Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms