Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE6

Cdkal1, Threonylcarbamoyladenosine tRNA methylthiotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkal1Q91WE6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkal1Q91WE6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms