Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms