Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp3Q91W36 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms