Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms