Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx9Q91VH2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms